Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms