Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNBD1Q8NA66 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms