Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC33Q8N5R6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms