Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC83Q8IWF9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC83Q8IWF9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms