Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLD3Q8IV08 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
PLD3Q8IV08 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLD3Q8IV08 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLD3Q8IV08 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLD3Q8IV08 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLD3Q8IV08 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLD3Q8IV08 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLD3Q8IV08 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms