Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB4Q86W47 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms