Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE3BQ7Z3V4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms