Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCQ7RTU9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms