Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms