Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM5Q71RC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM5Q71RC9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms