Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS12Q6ZW61 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms