Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC36A4Q6YBV0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms