Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms