Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL35Q6PF15 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms