Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL54Q6P161 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms