Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF544Q6NX49 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF544Q6NX49 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms