Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSAPQ6IQ19 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms