Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH2Q5VUJ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms