Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
OBSCNQ5VST9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms