Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRMS1LQ5PSV4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRMS1LQ5PSV4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms