Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF542PQ5EBM4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms