Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF2Q5BJF6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF2Q5BJF6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms