Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAN3Q58A45 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms