Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
ALFQ53S48 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms