Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TPRNQ4KMQ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms