Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms