Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF3Q496Y0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF3Q496Y0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms