Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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