Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBW0

NBPF9, Neuroblastoma breakpoint family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF9Q3BBW0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF9Q3BBW0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms