Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDRF1Q3B7T1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDRF1Q3B7T1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms