Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TWISTNBQ3B726 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms