Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSR1Q2NL82 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSR1Q2NL82 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms