Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSPP1Q1MSJ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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