Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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