Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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