Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXNQ16595 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXNQ16595 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXNQ16595 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXNQ16595 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXNQ16595 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXNQ16595 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FXNQ16595 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FXNQ16595 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FXNQ16595 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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FXNQ16595 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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FXNQ16595 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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FXNQ16595 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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FXNQ16595 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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FXNQ16595 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FXNQ16595 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FXNQ16595 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FXNQ16595 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FXNQ16595 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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