Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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