Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TNXAQ16473 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNXAQ16473 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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