Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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