Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms