Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK4Q16099 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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