Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS72Q15906 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms