Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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