Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRADDQ15628 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
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