Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3CQ15386 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
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