Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NKX1-1Q15270 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKX1-1Q15270 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms