Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCOLCEQ15113 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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