Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KARSQ15046 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KARSQ15046 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KARSQ15046 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KARSQ15046 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KARSQ15046 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KARSQ15046 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KARSQ15046 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KARSQ15046 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms