Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LAPTM4AQ15012 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms