Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCLAFQ15004 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCLAFQ15004 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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